Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syngr1O55100 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syngr1O55100 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms