Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptpn20O55082 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ptpn20O55082 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms