Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema6bO54951 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema6bO54951 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema6bO54951 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms