Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb3O54890 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb3O54890 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms