Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brs3O54798 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brs3O54798 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Brs3O54798 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brs3O54798 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms