Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cavin1O54724 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cavin1O54724 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms