Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
EdaO54693 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EdaO54693 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EdaO54693 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
EdaO54693 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EdaO54693 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EdaO54693 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EdaO54693 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EdaO54693 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms