Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab33bO35963 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab33bO35963 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms