Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SpibO35906 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpibO35906 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpibO35906 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpibO35906 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SpibO35906 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SpibO35906 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SpibO35906 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SpibO35906 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SpibO35906 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SpibO35906 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SpibO35906 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SpibO35906 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SpibO35906 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SpibO35906 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SpibO35906 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SpibO35906 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpibO35906 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SpibO35906 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SpibO35906 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpibO35906 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SpibO35906 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms