Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Timm44O35857 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm44O35857 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Timm44O35857 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Timm44O35857 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Timm44O35857 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Timm44O35857 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Timm44O35857 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Timm44O35857 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm44O35857 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Timm44O35857 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Timm44O35857 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Timm44O35857 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Timm44O35857 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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