Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cited2O35740 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cited2O35740 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms