Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Capn6O35646 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Capn6O35646 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms