Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prrt1O35449 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt1O35449 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms