Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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Dgcr6O35347 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Dgcr6O35347 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Dgcr6O35347 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Dgcr6O35347 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Dgcr6O35347 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dgcr6O35347 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Dgcr6O35347 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Dgcr6O35347 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dgcr6O35347 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms