Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Kpna6O35345 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Kpna6O35345 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms