Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kpna3O35344 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kpna3O35344 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms