Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ebi3O35228 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ebi3O35228 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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