Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nedd9O35177 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Nedd9O35177 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Nedd9O35177 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Nedd9O35177 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nedd9O35177 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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