Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cldn4O35054 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cldn4O35054 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms