Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Degs1O09005 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Degs1O09005 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms