Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Barx2O08686 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Barx2O08686 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Barx2O08686 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Barx2O08686 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Barx2O08686 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Barx2O08686 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Barx2O08686 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Barx2O08686 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Barx2O08686 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Barx2O08686 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms