Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rundc3aO08576 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rundc3aO08576 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms