Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Efna5O08543 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efna5O08543 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Efna5O08543 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms