Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm20878L7N244 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20878L7N244 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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