Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Gm21887J3QQ04 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms