Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm2056J3QQ02 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm2056J3QQ02 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms