Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spin2fJ3QPU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spin2fJ3QPU0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms