Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim34bJ3QNR8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim34bJ3QNR8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim34bJ3QNR8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim34bJ3QNR8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms