Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smim18J3QNP2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim18J3QNP2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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