Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ccdc180J3QNE4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
Ccdc180J3QNE4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ccdc180J3QNE4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ccdc180J3QNE4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms