Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700014D04RikJ3QMS2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms