Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21060J3KMU4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21060J3KMU4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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