Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21818J3KMS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21818J3KMS6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms