Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AK157302I3ITR1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AK157302I3ITR1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms