Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tubgcp6G5E8P0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tubgcp6G5E8P0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms