Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3tc1G3X9F6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3tc1G3X9F6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms