Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmigd3G3X8R9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmigd3G3X8R9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms