Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17455G3UW87 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm17455G3UW87 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm17455G3UW87 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm17455G3UW87 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17455G3UW87 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17455G3UW87 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17455G3UW87 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17455G3UW87 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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