Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20517G3UVU6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20517G3UVU6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms