Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ScaperF8VQ70 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms