Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Farp1F8VPU2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Farp1F8VPU2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms