Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arid4aF8VPQ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Arid4aF8VPQ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arid4aF8VPQ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms