Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn2r40F6W043 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn2r40F6W043 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms