Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BC067074F6RXI4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC067074F6RXI4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BC067074F6RXI4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC067074F6RXI4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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BC067074F6RXI4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BC067074F6RXI4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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BC067074F6RXI4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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BC067074F6RXI4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BC067074F6RXI4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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