Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prl3d2F6R3P9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prl3d2F6R3P9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms