Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TrdnE9Q9K5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TrdnE9Q9K5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms