Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc146E9Q9F7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc146E9Q9F7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc146E9Q9F7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms