Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Col22a1E9Q7P1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col22a1E9Q7P1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col22a1E9Q7P1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms