Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc85cE9Q6B2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc85cE9Q6B2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms