Protein–RNA interactions for Protein: E9Q649

Gcnt4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt4E9Q649 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Gcnt4E9Q649 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt4E9Q649 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gcnt4E9Q649 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Gcnt4E9Q649 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Gcnt4E9Q649 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Gcnt4E9Q649 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gcnt4E9Q649 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Gcnt4E9Q649 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gcnt4E9Q649 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gcnt4E9Q649 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms